Kampung Yuwanain merupakan kampung Ex Transmigrasi dengan penduduk yang berasal dari berbagai daerah.sedangkan penempatan pertama dikampung Yuwanain yang dulunya dikenal dengan Arso II,yaitu pada tanggal,29 Mei 1984 adalah transmigran dari daerah Malang,Pasuruan dan Bojonegoro,yang berjumlah 60KK yang tiba dilokasi Arso II pada jam 19:00wit.Kemudian pada bulan Agustus 1984 didatangkan Transmigran dari daerah Kebumen,Kudus dan Purwodadi,dan pada bulan Mei 1985 transmigrasi local dari kabupaten Jayapura.pada tahun 1986/1987 didatangkan lagi transmigran dari Trenggalek,Banyumas dan Nusa Tenggara Timur,yaitu dari daerah Flores,Sikka dan Maumere.

 Pada tahun 1990 Kampung Yuwanain diserahkan dari Departemen Transmigrasi ke Pemerintah daerah kabupaten Jayapura.Pejabat Kepala desa pertama yaitu Bpk.Goan Husein,pada masa transisi antara tahun 1989-1991.pemilihan kepala desa pertama pada tahun 1991 dan yang terpilih manjadi kkepala desa adalah Bpk,Kasno Midi.beliau menjabat kepala desa Yuwanain selama kurang lebih 3 thn.karena suatu hal maka Bpk.Kasno Midi mengundurkan diri dari jabatan kepala desadan dilanjutkan oleh sekretaris desa Bpk,Bambang Tri Kusumo Priyatama sebagai pejabat kepala desa hingga tahun 1996.

Pemilihan kepala desa yang kedua pada tahun 1996,dan yang terpilih sebagai kepala desa adalah Bpk.Sukoco,  SH.kemudian melalui rapat LMD menunjuk Sdr.Nuridwan sebagai sekretaris desa Yuwanain dan mulia aktif pada tanggal.28 November 1996.Bpk.Sukoco,SH menjabat kepala desa Yuwanain sampai tahun 2004.untuk mengisi kekosongan jabatan kepala desa,maka saudara Louis Womsiwor ditunjuk sebagai pejabat kepala desa hingga dilaksanakannya pemilihan kepala desa yang baru.

Pemilihan kepala kampung dilaksanakan pada hari sabtu,tanggal 19 November  2005,dan yang terpilih sebagai kepala desa[kepala kampung] adalah bpk.Pramono Suharjono,SH beliau menjabat kepala kampung sampai tahun 2009 kemudian mengundurkan diri jabatannya sebagai kepala kampung untuk mengikuti pencalonan anggota Legeslatif.untuk mengisi jabatan kepala kampumg yang kosong,Bp.Louis Womsiwor ditunjuk sebagai pejabat sementara sampai tahun 2011,kemudian pada tamggal 25 November 2011,pemilihan kepala kampung Yuanain adalah Bp.Hadi Susilo yang masih menjabat sampai sekarang.sejak tahun 2011 dengan adanya program bantuan keuangan  kepada kampung[BK3],telah banyak perubahan yang di sarankan manfaatnya,dengan adanya pembangunan dibidang  infrastruktur,perumahan,kesehatan,pendidikan dan ekonomi produktif,dibidang infrastruktur telah banyak dibangun badan jalan lahan produktif,sehingga mempermudah distribusi hasil pertanian dan memberikan semangat untuk para petani untuk menggarap lahan dengan adanya jalan lahan yang baik. Kemudian dengan adanya dana PNPM-Mandiri-Respek, telah banyak jembatan yang dibangun permanen,namun karena perkembangan penduduk dan luas wilayah serta tuntutan kebutuhan masyarakat,masih banyak program pembangunan yang harus dilaksanakan.